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在柱內裝著填料的色譜柱稱為填充柱。填充柱又分一般填充柱、微填充柱和填充毛細管柱。

由于填充柱的制備和使用方法都比較容易掌握，而且具有多種填料可供選擇，能滿足一般樣品的分析要求，因此，氣相色譜儀設備所采用的填充柱是應用較為普遍的一種色譜柱。

填充柱的缺點是滲透性較差，傳質阻力較大，柱子不能過長(一般小于4米)，故其分離效能受到一定的限制。

(1)一般填充柱 內徑2^-6毫米、內填顆粒填料的柱子稱為一般填充柱。由于填充柱能承受較大的樣品負荷量，故可用于制備色譜，制備色譜用的填允柱柱徑則可大到數(shù)百毫米。

(2)微填充往 若采用內徑小于(或等于)1毫米的柱管，內填小順粒填料 的柱子則稱微填充柱。微填充柱中，填料篩分范圍要求很窄。因填充均勻性較好，故用較短的色譜柱亦能獲得較高的柱效。 微填充柱對試樣的負荷量較小，因而需要采用較靈敏的檢測器。

(3)填充毛細管柱 將多孔性填料疏松地裝入玻璃管中，然后拉制成內徑為 0.25-0.50毫米的柱子稱為填充毛細管柱。制備時應選用熱穩(wěn) 定性良好的材料作填料，

例如:涂有固定液的硅藻土、碳分子 篩、活性氧化鋁等。填充毛細管柱具有填充柱和毛細管柱的共 同優(yōu)點:填充密度較小、柱效較高和分析速度較快等。